計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系是在我校計算數(shù)學(xué)等專業(yè)的基礎(chǔ)上于1982年成立，是國內(nèi)最早的同類科系之一，曾用名為計算機(jī)與系統(tǒng)科學(xué)系和計算機(jī)科學(xué)系，先后設(shè)有計算機(jī)軟件、控制理論和系統(tǒng)工程等專業(yè)；1991年，根據(jù)學(xué)科發(fā)展需要，分別成立了計算機(jī)科學(xué)系和系統(tǒng)科學(xué)系。2001年獲批另行成立國家示范性軟件學(xué)院。2007年，智能科學(xué)與技術(shù)系另行成立，2021年改名計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系（簡稱計算機(jī)系）。

  計算機(jī)科學(xué)技術(shù)系擁有完整的高端人才培養(yǎng)體系，包括博士后科研流動站、工學(xué)博士、工程博士、工學(xué)碩士及工學(xué)學(xué)士授予點(diǎn)，招收博士生、學(xué)術(shù)型、專業(yè)型碩士生及計算機(jī)技術(shù)工程碩士生、本科生等。計算機(jī)系涵蓋兩個一級學(xué)科：計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)，網(wǎng)絡(luò)空間安全。三個二級學(xué)科： 計算機(jī)應(yīng)用技術(shù)，計算機(jī)軟件與理論，計算機(jī)體系結(jié)構(gòu)。計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)為福建省重點(diǎn)一級學(xué)科,計算機(jī)軟件與理論及軟件工程為省重點(diǎn)二級學(xué)科，是國家“卓越工程師計劃”人才培養(yǎng)單位，計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)本科專業(yè)為國家一流本科專業(yè)。曾先后獲得國家“211工程”一期、二期和“985工程”一期、二期創(chuàng)新研究平臺項(xiàng)目支持，其中視頻與圖像信息處理是立項(xiàng)支持的重點(diǎn)研究方向之一。

  計算機(jī)系現(xiàn)設(shè)有三個研究所(與三個二級學(xué)科對應(yīng))和一個公共計算機(jī)教學(xué)部。公共計算機(jī)教學(xué)部承擔(dān)全校理工、經(jīng)濟(jì)、人文、藝術(shù)等非本學(xué)科各學(xué)院各系的計算機(jī)基礎(chǔ)和程序設(shè)計課程。

        計算機(jī)系擁有富有活力、實(shí)力雄厚的師資隊(duì)伍， 45歲及以下年青教師占近80%，未來每年還將持續(xù)引進(jìn)多批次高水平人才。我系在軟件算法與理論、未來視頻技術(shù)、計算機(jī)視覺與機(jī)器學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)庫理論及其應(yīng)用、大數(shù)據(jù)處理與計算智能、醫(yī)學(xué)信息處理與數(shù)字醫(yī)療技術(shù)、空間感知與遙感信息處理、計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)與信息安全、智能系統(tǒng)、智能多媒體技術(shù)、數(shù)據(jù)挖掘方法、系統(tǒng)軟件與軟件工程、計算方法及應(yīng)用、生物信息處理、高性能存儲系統(tǒng)等具體方向上開展了卓有成效的研究工作。近五年已在國內(nèi)外有影響力的學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表數(shù)百篇文章(SCI、EI收錄檢索的論文)，包括IEEE Trans. PAMI, IEEE Trans. on Computers, IEEE Trans. on VCG, IEEE Trans. on IP，計算機(jī)學(xué)報，軟件學(xué)報，CCF A類會議IJCAI, ACM Multimedia等，獲得省部級獎3項(xiàng)。我系教師積極開展科學(xué)研究，已經(jīng)完成或正在承擔(dān)一大批科研項(xiàng)目，包括海峽聯(lián)合基金項(xiàng)目、國家973子題、國家863計劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)重大儀器專項(xiàng)、面上基金、青年基金、福建省科技重大項(xiàng)目基金、總裝預(yù)研項(xiàng)目，以及較大量的企事業(yè)單位委托項(xiàng)目等。